La reina Nefertiti se unió a su esposo en la adoración de la nueva religión de Atón, el poder del disco solar. Ella y su esposo actuaban como mediadores entre el pueblo y Atón, y se creía que la bendición completa solo podía recibirse cuando la pareja real estaba unida.

Durante los primeros años del reinado de su esposo, Nefertiti cambió su nombre a Neferneferuatón Nefertiti, que significa “Atón brilla porque ha llegado la bella”.

Nefertiti apoyó a su esposo durante sus reformas religiosas y sociales, y luego se trasladó con él a Akhetatón (Tell el-Amarna).
Aparecía junto a él en ceremonias, rituales, escenas familiares, e incluso en escenas militares tradicionales, donde se la muestra derrotando enemigos.